烟草ovate 同源基因的全长cDNA 克隆与序列分析

桂蓓1,2,王瑛1,*
1 中国科学院武汉植物园,武汉430074;2 中国科学院研究生院,北京100049

通信作者:1,2,王瑛;E-mail: yingwang@wbgcas.cn;Tel: 027-87510675

摘 要:

根据番茄中控制果实形状的主效数量性状基因 ovate 的序列,用生物信息学方法从茄科植物烟草中获得直系同源 ovate 基因(NTovate)的特异片段,经鉴定,此基因在烟草中至少有 2 个拷贝。在此基础上用 cDNA末端快速扩增(RACE)方 法,获得其中 1 个拷贝的 1 059 bp NTovate 全长 cDNA 序列。序列分析表明,NTovate cDNA 序列编码 352 个氨基酸,其 蛋白序列与番茄 ovate 蛋白序列和拟南芥 ovate 蛋白家族 AtOFP7 蛋白分别为 70% 和 36% 的序列一致率,而与此家族中其 他蛋白以及水稻 ovate 蛋白仅在保守的 ovate 结构域有较低的同源性。此基因已在 GenBank 中登录(EU043369)。

关键词:烟草;ovate 同源基因;全长 cDNA;序列分析

收稿:2007-08-28   修定:2007-11-16

资助:国家自然科学基金(30570172)和武汉市晨光项目(20045006071-34)。

烟草ovate 同源基因的全长cDNA 克隆与序列分析

桂蓓1,2,王瑛1,*
1 中国科学院武汉植物园,武汉430074;2 中国科学院研究生院,北京100049

Corresponding author: ; E-mail: yingwang@wbgcas.cn; Tel: 027-87510675

Abstract:

根据番茄中控制果实形状的主效数量性状基因 ovate 的序列,用生物信息学方法从茄科植物烟草中获得直系同源 ovate 基因(NTovate)的特异片段,经鉴定,此基因在烟草中至少有 2 个拷贝。在此基础上用 cDNA末端快速扩增(RACE)方 法,获得其中 1 个拷贝的 1 059 bp NTovate 全长 cDNA 序列。序列分析表明,NTovate cDNA 序列编码 352 个氨基酸,其 蛋白序列与番茄 ovate 蛋白序列和拟南芥 ovate 蛋白家族 AtOFP7 蛋白分别为 70% 和 36% 的序列一致率,而与此家族中其 他蛋白以及水稻 ovate 蛋白仅在保守的 ovate 结构域有较低的同源性。此基因已在 GenBank 中登录(EU043369)。

Key words: 烟草;ovate 同源基因;全长 cDNA;序列分析

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